3DSlicer模块简介

3DSlicer模块简介

3DSlicer的强大功能依赖于众多的模块(插件),因为开源世界各地的编程爱好者都可以根据需要创造新的模块。3DSlicer软件目前自带模块100余个,还有扩展模块100多个,扩展模块需要进行安装后使用,初学者面对众多的模块往往一头雾水,不知道应该安装哪个模块。这里对常用模块做一个简介。

一、Diffusion(扩散)

  • ResampleDTIlogEuclidean:DTI重采样。
  • SlicerDMRI:SlicerDMRI是Slicer Diffusion MRI功能的扩展。
  • UKFTractography:该模块使用多张量无迹卡尔曼滤波器方法跟踪DWI中的纤维束。

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二、Exporter(输出)

  • SlicerToKiwiExporter:该模块为Slicer用户提供了将模型导出到KiwiViewer场景文件的简便方法。

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三、IGT

  • GyroGuide:3D Slicer的python扩展可以帮助外科医生规划穿刺方向。

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四、Informatics(信息)

  • CurveMaker:这是一个基于基准点列表生成曲线的模块。

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  • MarkupsToModel:从标记基准节点的点创建管状或闭合表面模型。

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五、Segmentation(分割)

  • ROBEXBrainExtraction:这个扩展旨在从头骨中提取大脑。该工具使用T1 MRI图像进行了深入测试,但可应用于任何其他结构MRI图像,即T2和PD。

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  • SegmentEditorExtraEffects:Segment Editor的分割工具。

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  • VolumeClip:使用曲面模型和ROI框剪辑体数据。

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  • SwissSkullStripper:用于MR和CT头部的颅骨剥离模块。

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  • Autoscroll:使用切片范围和速度自动滚动切片。

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  • PETTumorSegmentation:PET扫描中的肿瘤和淋巴结分割。

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  • Slicer-Wasp:用于执行一系列ITK分水岭分割(无种子),然后让用户从所选组件中创建标签图。还将生成等值面模型。

六、Training(训练)

  • PedicleScrewSimulator:用于椎弓根螺钉插入训练的模块。

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七、Virtual Reality(虚拟现实)

  • SlicerVirtualReality:允许用户使用虚拟现实与Slicer场景进行交互。

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八、Web System Tools(网络系统工具)

  • DatabaseInteractor:此扩展可以与数据库和本地文件夹中的在线数据进行交互。

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九、Cameras(摄像机)

  • VideoCameras:此扩展包含用于与静态和摄像机交互的模块(校准,捕获等)。

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十、Cardiac(心脏)

  • CardiacAgatstonMeasures:该模块将自动分割心脏CT扫描中的冠状动脉钙化,然后计算Agatston评分和标签统计数据。

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  • SlicerHeart:用于心脏分析和干预计划和指导的模块。

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如进行脑出血定位需要安装的常用模块:CurveMaker(曲线测量)、GyroGuide(规划穿刺方向)、VolumeClip(体数据剪裁)、SegmentEditorExtraEffects(Segment Editor扩展工具)。

作者:曹玉福

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